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Mestrado em Biologia Computacional

Apresentação


O Mestrado em Biologia Computacional (MBC), envolvendo 5 departamentos da FCTUC, tem intrinsecamente um caráter interdisciplinar. Consequentemente está preparado para alunos com diferentes formações de base (biólogos, bioquímicos, físicos, matemáticos, …) e desenhado de modo a dar uma formação na área de Biologia Computacional adequada ao respetivo perfil do aluno. Os objetivos formativos deste mestrado incluem a aquisição de um robusto conhecimento científico e técnico e elevadas competências em tópicos associados à aplicação dos princípios, métodos e técnicas da Biologia Computacional a áreas de investigação biológica, biomedicina e biotecnologia. Em particular o estudante deste mestrado irá ser capaz de utilizar e desenvolver ferramentas computacionais para o estudo de grandes quantidades de dados biológicos (por exemplo provenientes de estudos genómicos ou proteómicos), utilizar ferramentas de modelação de sistemas em biologia estrutural de modo a acompanhar o desenvolvimento de novos fármacos ou a investigar a dinâmica de biomoléculas, desenvolver modelos matemáticos e computacionais capazes de simular sistemas biológicos e o desenvolvimento de patologias, tanto a nível intracelular como ao nível do tecido, e estar atualizado quanto ao estado da arte da Biologia Computacional. Estas competências permitirão ao estudante apoiar o desenvolvimento científico-tecnológico no contexto da biologia e/ou da biotecnologia tanto em ambiente do laboratório como empresarial. É sem dúvida uma área de especialização essencial hoje em dia tanto na investigação, como na criação de novas soluções quantitativas no sistema empresarial relacionado com a biotecnologia.

Plano do curso

1º ANO - 1º Semestre

NOME DA CADEIRA TIPO ÁREA CIENTÍFICA ECTS
Análise de Dados Biológicos Obrigatória Biologia Computacional 6
OMICAs Aplicadas Obrigatória Biologia Computacional 6
Bioinformática Obrigatória Informática 6
Opção 1 Opcional  6
Opção 2 Opcional  6
No 1º semestre o estudante deverá inscrever-se em duas disciplinas de opção, num total de 12 ECTS, de entre a lista que se segue:
NOME DA CADEIRA TIPO ÁREA CIENTÍFICA ECTS
Amostragem e Sondagens Opcional Matemática 6
Biologia Molecular e Celular Opcional Biologia 6
Bioquímica Opcional Bioquímica 6
Complementos de Análise Matemática Opcional Matemática 6
Computação Paralela Opcional Métodos Numéricos 6
Informática Clínica e Sistemas de Tele-Saúde Opcional Informática 6
Inovação e Empreendedorismo Tecnológico Opcional Gestão 6
Inteligência Artificial Opcional Informática 6
Métodos Computacionais em Biologia Opcional Métodos Numéricos 6
Métodos Heurísticos Opcional Informática 6
Métodos Matemáticos da Física e Biologia Opcional Informática 6
Princípios de Fisiologia Humana Opcional Biologia 6
Processos e Cálculo Estocástico Opcional Matemática 6
Quimiometria Opcional Química 6
Teoria dos Jogos Opcional Matemática 6
Termodinâmica e Cinética Químicas Opcional Química 6

1º ANO - 2º Semestre

NOME DA CADEIRA TIPO ÁREA CIENTÍFICA ECTS
Aprendizagem Computacional em Biologia Obrigatória Informática 6
Biologia de Sistemas Molecular Obrigatória Biologia Computacional 6
Descoberta Computacional de Fármacos Obrigatória Química 6
Modelação Quantitativa em Biologia Obrigatória Biologia Computacional 6
Opção 3 Opcional  6
No 1º semestre o estudante deverá inscrever-se numa disciplina de opção, num total de 6 ECTS, de entre a lista que se segue:
NOME DA CADEIRA TIPO ÁREA CIENTÍFICA ECTS
Algoritmos de Diagnóstico e Auto-Regulação Opcional Informática 6
Computação Evolucionária Opcional Informática 6
Enzimologia Opcional Bioquímica 6
Introdução ao Metabolismo Opcional Biologia 6
Métodos Numéricos para Equações com Derivadas Parciais Opcional Métodos Numéricos 6
Modelação e Simulação Opcional Química 6
Otimização Numérica Opcional Matemática 6
Simulação Opcional Informática 6
Sistemas Complexos Opcional Informática 6
Visualização Computacional Opcional Informática 6

2º ANO - 1º Semestre

NOME DA CADEIRA TIPO ÁREA CIENTÍFICA ECTS
Dissertação (Anual) Obrigatória Biologia Computacional 18
Opção 4 Opcional Biologia 6
Opção 5 Opcional Biologia 6
No 1º semestre o estudante deverá inscrever-se em duas disciplinas de opção, num total de 12 ECTS, de entre a lista que se segue:
NOME DA CADEIRA TIPO ÁREA CIENTÍFICA ECTS
Amostragem e Sondagens Opcional Matemática 6
Biologia da Reprodução Opcional Biologia 6
Biotecnologia Molecular Opcional Biologia 6
Circuitos Neuronais e Comportamento Opcional Biologia 6

Computação Paralela

Opcional Métodos Numéricos 6
Informática Clínica e Sistemas de Tele-Saúde Opcional Informática 6

Inovação e Empreendedorismo Tecnológico

Opcional Gestão 6
Inteligência Artificial Opcional Informática 6
Métodos Heurísticos Opcional Informática 6
Métodos Matemáticos da Física e da Biologia Opcional Matemática 6
Neurobiologia Celular e Molecular Opcional Biologia 6
Princípios de Fisiologia Humana Opcional Biologia 6
Processos e Cálculo Estocástico Opcional Matemática 6
Quimiometria Opcional Química 6
RMN Biomédico e Imagiologia Molecular Opcional Biologia 6
Regulação Celular Opcional Biologia 6
Teoria dos Jogos Opcional Matemática 6
Termodinâmica e Cinética Químicas Opcional Química 6
Toxicidade e Doença Opcional Biologia 6

2º ANO - 2º Semestre

NOME DA CADEIRA TIPO ÁREA CIENTÍFICA ECTS
Dissertação (Anual) Obrigatória Biologia Computacional 26
Escrita Científica Obrigatória Gestão Científica 4
O trabalho a desenvolver durante um ano letivo, de acordo com o plano indicativo do ciclo de estudos e em regime de tempo integral, corresponde a 60 ECTS, pelo que o estudante deve inscrever-se a duas disciplinas de opção da lista disponível no 1º Semestre do 1º Ano.
As unidades curriculares optativas são anualmente oferecidas consoante a disponibilidade da Unidade Orgânica.

Informações gerais

  • Nome do curso: Mestrado em Biologia Computacional
  • Tipo: 2º Ciclo
  • Classificação atribuída: Mestre
  • Coordenação do curso: Profª Doutora Irina Moreira (irina.moreira@uc.pt)
  • Coordenador da mobilidade: Prof. Doutor António Coutinho (cafe@bot.uc.pt)
  • Objectivos: Este programa de estudos de segundo ciclo pretende dotar os alunos de uma visão abrangente e integrada dos tópicos científicos, tecnológicos, técnicos e éticos associados à Biologia Computacional.
    Após conclusão do grau o estudante deve (i) demonstrar um bom conhecimento de biologia fundamental, (ii) estar familiarizado com as principais fontes de dados biológicos e biomoleculares, (iii) dominar as principais linguagens de programação e ferramentas de análise utilizadas em Biologia Computacional, e (iv) demonstrar sólidas aptidões para a modelação de sistemas e análise de dados biológicos e biomoleculares, tanto num contexto de investigação fundamental como de aplicação biomédica e biotecnológica.
  • Duração: 4 semestres
  • ECTS: 120
  • Saídas Profissionais: As principais saídas profissionais são investigação e serviços em ambiente empresarial ou académico nas áreas de biotecnologia e biomedicina. Existem já a nível nacional, e em particular no eixo Coimbra-Cantanhede, múltiplas empresas (por exemplo, Coimbra Genomics, BSIM Therapeutics, Ophiomics, SilicoLife) e serviços (por exemplo Genoinseq) que têm a biologia computacional como eixo central da sua atividade. Além disso, a biologia computacional tem uma importância central e crescente na medicina personalizada e no diagnóstico clínico avançado, que motivam uma crescente procura por profissionais com esta formação no setor da saúde. Também na investigação em biomedicina e biotecnologia realizada nos centros de investigação nacionais, a biologia computacional tem vindo a ganhar importância crescente. A atual escassez de recursos humanos na área de Biologia Computacional é já uma limitação reconhecida ao desenvolvimento destas empresas e instituições.
    Exemplos de atividades nas empresas e instituições acima que requerem biólogos computacionais incluem (i) a modelação de processos bioquímicos e fisiológicos ao serviço da descoberta de novas terapias, (ii) a modelação molecular ao serviço do desenvolvimento de fármacos, (iii) a análise de dados genómicos, metabolómicos e proteómicos ao serviço do diagnóstico clínico e da perfilagem/adaptação de organismos para fins biotecnológicos, (iv) a análise de imagens de microscopia e em imagiologia médica.
  • Numerus clausus: 20
  • Valor anual da propina: Estudante Nacional: 1.063,47€ / Estudante Internacional: 7.000€
  • Condições de ingresso: a) Titulares do grau de licenciado ou equivalente legal em Biologia, Bioquímica, Biologia Celular e Molecular, Química, Química Medicinal, Matemática, Matemática Aplicada, Física, Engenharia Física, Física Tecnológica, Física Aplicada, Engenharia Biomédica, Ciências Farmacêuticas, Ciências da Computação, Engenharia Informática, Engenharia Eletrotécnica e de Computadores ou áreas afins, ou licenciatura pré­Bolonha numa destas áreas, sendo que só serão admitidos candidatos(as) com 1ª ciclo concluído cujos planos de estudo incluam 12 ECTS na área científica de matemática ou 6 ECTS em estatística ou bioestatística;
    b) Detentores de um currículo escolar, científico ou profissional, que seja reconhecido como atestando capacidade para realização deste ciclo de estudos.
  • Mais informação: Website da UC

Dissertações apresentadas

Pode CONSULTAR as dissertações que foram apresentadas no Departamento de Ciências da Vida no âmbito deste mestrado.

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