COI possui um grande número de exemplares da flora portuguesa, resultado de várias décadas de expedições organizadas pelo Herbário e a colaboração de membros da Sociedade Broteriana. Em 2015, o 135º aniversário deste espólio, retomaram-se as saídas de campo após três décadas de interrupção. O objectivo é colher espécies aqui pouco representadas ou não representadas.
