Nos termos do disposto no artigo 3.º dos seus Estatutos, a Faculdade Farmácia da Universidade de Coimbra tem como principal missão a criação de conhecimento e a sua disseminação.
A prestação de serviços especializados nas suas mais variadas vertentes, pelo seu caráter histórico e humanista, consubstancia a relação da instituição com a sociedade civil.